Pediatric Hematology/Oncology and ImmunopathologyPediatric Hematology/Oncology and ImmunopathologyВопросы гематологии/онкологии и иммунопатологии в педиатрии1726-17082414-9314Fund Doctors, Innovations, Science for Children109610.24287/j.1096ORIGINAL ARTICLESОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИResearch ArticleSomatic oncogenic events in Shwachman–Diamond syndrome: molecular genetic characterization and clinical significanceСоматические события с онкогенным потенциалом при синдроме Швахмана–Даймонда: молекулярно-генетическая характеристика и клиническое значениеhttps://orcid.org/0009-0003-6363-9602MalyasovaN. S.МалясоваН. С.
Russian Federation

MD in Clinical Laboratory Medicine at the Laboratory of Molecular Biology

врач клинической лабораторной диагностики лаборатории молекулярной биологии

nataliya.malyasova@dgoi.ruhttps://orcid.org/0000-0002-3974-5662PavlovaA. V.ПавловаА. В.
Russian Federation
nataliya.malyasova@dgoi.ruhttps://orcid.org/0000-0002-1085-4646KazakovaA. N.КазаковаА. Н.
Russian Federation
nataliya.malyasova@dgoi.ruhttps://orcid.org/0000-0002-8208-2075DeordievaE. A.ДеордиеваЕ. А.
Russian Federation
nataliya.malyasova@dgoi.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9857-4456RodinaY. A.РодинаЮ. А.
Russian Federation
nataliya.malyasova@dgoi.ruhttps://orcid.org/0000-0002-3113-4939ShcherbinaA. Y.ЩербинаА. Ю.
Russian Federation
nataliya.malyasova@dgoi.ruhttps://orcid.org/0000-0002-8805-1499SmetaninaN. S.СметанинаН. С.
Russian Federation
nataliya.malyasova@dgoi.ruhttps://orcid.org/0000-0002-7634-2053RaykinaE. V.РайкинаЕ. В.
Russian Federation
nataliya.malyasova@dgoi.ruThe Dmitry Rogachev National Medical Research Center of Pediatric Hematology, Oncology and Immunology of Ministry of Healthcare of the Russian FederationФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр детской гематологии, онкологии и иммунологии им. Дмитрия Рогачева» Минздрава России1404202625168731602202619022026Copyright ©; 2026, «D. Rogachev NMRCPHOI»Copyright ©; 2026, ФГБУ «НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева» Минздрава России2026«D. Rogachev NMRCPHOI»ФГБУ «НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева» Минздрава Россииhttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://hemoncim.com/jour/article/view/1096

Introduction. Shwachman–Diamond syndrome (SDS) is a hereditary bone marrow failure syndrome associated with an increased risk of myeloid neoplasms. Somatic genetic events play a significant role in the pathogenesis of malignant transformation in SDS; however, their clinical significance remains understudied.

Aim. To study the spectrum of somatic genetic and cytogenetic changes in patients with SDS and their potential association with myeloid transformation.

Materials and methods. The study included 41 patients with SDS. High-throughput sequencing using the “Clonality of Hematopoiesis” targeted gene panel and cytogenetic testing by fluorescence in situ hybridization were performed. The frequency, type, and variant allele frequency (VAF) of the somatic variants were analyzed.

Results. Somatic transforming events were detected in 21.9% of the patients. Most commonly found were variants in the TP53 gene, mainly with low VAF and no signs of malignant transformation. Myeloid neoplasms developed in the presence of high-VAF mutations or alternative oncogenic events.

Conclusion. The obtained data demonstrate the heterogeneity of myeloid transformation pathways in SDS and highlight the need for comprehensive molecular genetic testing in the clinical monitoring of affected patients.

Введение. Синдром Швахмана–Даймонда (СШД) относится к наследственным синдромам костномозговой недостаточности и ассоциирован с повышенным риском развития миелоидных новообразований. Существенную роль в патогенезе злокачественной трансформации при СШД играют соматические генетические события, однако их клиническое значение остается недостаточно изученным.

Цель исследования – оценить спектр соматических генетических и цитогенетических изменений у пациентов с СШД и их возможную связь с миелоидной трансформацией.

Материалы и методы. В исследование включен 41 пациент с СШД. Выполнены высокопроизводительное секвенирование с помощью таргетной панели генов «Клональность гемопоэза» и цитогенетическое исследование методом флуоресцентной гибридизации in situ (fluorescence in situ hybridization). Проанализированы частота, тип и частота вариантных аллелей соматических изменений.

Результаты. Соматические трансформирующие события выявлены у 21,9% пациентов. Наиболее часто обнаруживались варианты в гене TP53, преимущественно с низкой аллельной фракцией и без признаков злокачественной трансформации. Миелоидные новообразования развивались при наличии высокоаллельных мутаций или альтернативных онкогенных событий.

Заключение. Полученные данные свидетельствуют о гетерогенности путей миелоидной трансформации при СШД и подчеркивают необходимость комплексной молекулярно-генетической оценки при клиническом наблюдении пациентов.

Shwachman–Diamond syndromesomatic mutationsclonal hematopoiesisTP53myeloid neoplasmsсиндром Швахмана–Даймондасоматические мутацииклональный гемопоэзTP53миелоидные новообразованияMyers K.C., Bolyard A.A., Otto B., Wong T.E., Jones A.T., Harris R.E. et al. Variable clinical presentation of Shwachman–Diamond syndrome: update from the North American Shwachman–Diamond Syndrome Registry. J Pediatr 2014;164(4):866–70.Dror Y., Freedman M.H. Shwachman–Diamond syndrome marrow cells show abnormally increased apoptosis mediated through the Fas pathway. Blood 2001;97(10):3011–6.Frattini A., Bolamperti S., Valli R., Cipolli M., Pinto R.M., Bergami E. et al. Enhanced p53 levels are involved in the reduced mineralization capacity of osteoblasts derived from Shwachman–Diamond syndrome subjects. Int J Mol Sci 2021;22(24):13331.Reilly C.R., Shimamura A. Predisposition to myeloid malignancies in Shwachman–Diamond syndrome: biological insights and clinical advances. Blood 2023;141(13):1513–23.Myers K.C., Furutani E., Weller E., Siegele B., Galvin A., Arsenault V. et al. Clinical features and outcomes of patients with Shwachman–Diamond syndrome and myelodysplastic syndrome or acute myeloid leukaemia: a multicentre, retrospective, cohort study. Lancet Haematol 2020;7(3):e238–46.Mellink C.H.M., Alders M., van der Lelie H, Hennekam R.H.C., Kuijpers T.W. SBDS mutations and isochromosome 7q in a patient with Shwachman–Diamond syndrome: no predisposition to malignant transformation. Cancer Genet Cytogenet 2004;154(2):144–9.Inaba T., Honda H., Matsui H. The enigma of monosomy 7. Blood 2018;131(26):2891–8.Taylor W.R., Stark G.R. Regulation of the G2/M transition by p53. Oncogene 2001;20(15):1803–15.Wu X., Deng Y. Bax and BH3-domain-only proteins in p53-mediated apoptosis. Front Biosci 2002;7:d151–6.Pestov D.G., Strezoska Z., Lau L.F. Evidence of p53-dependent cross-talk between ribosome biogenesis and the cell cycle: effects of nucleolar protein Bop1 on G(1)/S transition. Mol Cell Biol 2001;21(13):4246–55.Elghetany M.T., Alter B.P. p53 protein overexpression in bone marrow biopsies of patients with Shwachman–Diamond syndrome has a prevalence similar to that of patients with refractory anemia. Arch Pathol Lab Med 2002;126(4):452–5.Shimamura A. Shwachman–Diamond syndrome. Semin Hematol 2006;43(3):178–88.Lindsley R.C., Saber W., Mar B.G., Redd R., Wang T., Haagenson M.D. et al. Prognostic mutations in myelodysplastic syndrome after stem-cell transplantation. N Engl J Med 2017;376(6):536–47.Tan S., Kermasson L., Hilcenko C., Kargas V., Traynor D., Boukerrou A.Z. et al. Somatic genetic rescue of a germline ribosome assembly defect. Nat Commun 2021;12(1):5044.Kennedy A.L., Myers K.C., Bowman J., Gibson C.J., Camarda N.D., Furutani E. et al. Distinct genetic pathways define pre-malignant versus compensatory clonal hematopoiesis in Shwachman–Diamond syndrome. Nat Commun 2021;12(1):1334.