Хромосомные аберрации как причина комплексного фенотипа у детей с первичными иммунодефицитами

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

Большая часть известных первичных иммунодефицитов (ПИД) является моногенными заболеваниями, преимущественно, с точечными дефектами в генах иммунной системы. Однако в редких случаях к иммунодефициту приводят различные хромосомные аберрации. Мы оценили ретроспективно группу из 15 пациентов с клиническими и лабораторными признаками иммунодефицита, у которых хромосомные аберрации были обнаружены различными методами. У шести пациентов из четырёх семей микроделеция включала ген (CTLA4, NFKB1) или часть известного гена ПИД (NBAS, DCLRE1C). У четверых пациентов имел место комплексный фенотип, когда мутация в известном гене ПИД (BTK, CYBB, STAT1 GOF, ATM) сочеталась с каким-либо хромосомным дефектом. В одном случае гомозиготное повреждение гена USB1 было подтверждено обнаружением однородительской дисомии хромосомы 16. У двоих пациентов были обнаружены известные иммунодефициты, связанные с хромосомными дефектами – синдром ДиДжорджи2 и синдром Якобсена. Ещё у двоих пациентов были выявлены различные аномалии хромосом, ранее не описанные при ПИД. 12/15пациентов (80%) имели особенности фенотипа – различные дисморфизмы скелета, пороки развития, а также задержку развития.

Гены, вовлечённые в развитие иммунодефицитов, могут быть повреждены в результате хромосомных аберраций. Для поиска генетического дефекта у пациентов с ПИД важна комбинация различных методов генетической диагностики. При этом отсутствие фенотипических особенностей не исключает необходимости использования для диагностики ПИД методов хромосомного анализа.

About the authors

НМИЦ ДГОИ им.Дмитрия Рогачёва

Author for correspondence.
Email: plunge@list.ru
Russian Federation

References

  1. Rezaei N, Aghamohammadi A, Notarangelo LD. Primary Immunodeficiency Diseases: Definition, Diagnosis, and Management. 2nd ed. Berlin: Springer-Verlag Berlin Heidelberg (2017)
  2. Seleman M, Hoyos-Bachiloglu R, Geha RS and Chou J (2017) Uses of Next-Generation Sequencing Technologies for the Diagnosis of Primary Immunodeficiencies. Front. Immunol. 8:847. doi: 10.3389/fimmu.2017.00847
  3. Zarrei M, MacDonald JR, Merico D, Scherer SW. A copy number variation map of the human genome. Nat Rev Genet. 2015;16:172–83
  4. Manning M, Hudgins L, Practice Professional, and Committee Guidelines. Array-based technology and recommendations for utilization in medical genetics practice for detection of chromosomal abnormalities. Genet Med. 2010;12:742–5
  5. Heimall JR, Hagin D, Hajjar J, Henrickson SE, Hernandez-Trujillo HS, Tan Y, Kobrynski L, Paris K, Torgerson TR, Verbsky JW, Wasserman RL, Hsieh EWY, Blessing JJ, Chou JS, Lawrence MG, Marsh RA, Rosenzweig SD, Orange JS, Abraham RS. Use of Genetic Testing for Primary Immunodeficiency Patients. J Clin Immunol. 2018 Apr;38(3):320-329. doi: 10.1007/s10875-018-0489-8. Epub 2018 Apr 19. Erratum in: J Clin Immunol. 2018 May 21;: PMID: 29675737.
  6. T, Chinn IK, Coban Akdemir ZH, et al. Primary immunodeficiency diseases: genomic approaches delineate heterogeneous Mendelian disorders.J Allergy Clin Immunol. 2017;139:232–45.
  7. Miller DT, Adam MP, Aradhya S, Biesecker LG, Brothman AR, Carter NP, et al. Consensus statement: chromosomal microarray is a first-tier clinical diagnostic test for individuals with developmental disabilities or congenital anomalies. Am J Hum Genet. 2010;86:749–64
  8. Favier R, Akshoomoff N, Mattson S, Grossfeld P. Jacobsen syndrome: advances in our knowledge of phenotype and genotype. Am J Med Genet C Semin Med Genet 2015;169:239–250.
  9. Sgardioli IC, Vieira TP, Simioni M, Monteiro FP, Gil-da-Silva-Lopes VL. 22q11.2 Deletion Syndrome: Laboratory Diagnosis and TBX1 and FGF8 Mutation Screening. J Pediatr Genet. 2015;4(1):17-22. doi: 10.1055/s-0035-1554976
  10. Lindstrand A, Malmgren H, Verri A. et al.Molecular and clinical characterization of patients with overlapping 10p deletions. Am J Med Genet A. 2010;152A(5):1233–1243.
  11. Masmas TN, Ifversen M, Ek J, Schejbel L, Marquart HV, et al. (2014) Application of aCGH Analysis in Patients with Primary. Immunodeficiency of Unknown Genetic Origin – Identification of Atypical SAP Deficiency and Coronin-1a Deficiency. J Clin Cell. Immunol 5: 201. doi: 10.4172/2155-9899.1000201
  12. Schatorjé E, van der Flier M, Seppänen M, Browning M, Morsheimer M, Henriet S, Neves JF, Vinh DC, Alsina L, Grumach A, Soler-Palacin P, Boyce T, Celmeli F, Goudouris E, Hayman G, Herriot R, Förster-Waldl E, Seidel M, Simons A, de Vries E. Primary immunodeficiency associated with chromosomal aberration - an ESID survey. Orphanet J Rare Dis. 2016 Aug 2;11(1):110. doi: 10.1186/s13023-016-0492-1.
  13. Farmand S, Sundin M. Hyper-IgE syndromes: recent advances in pathogenesis, diagnostics and clinical care. Curr Opin Hematol. 2015 Jan;22(1):12-22. doi: 10.1097/MOH.0000000000000104. Review.
  14. Adam MP, Banka S, Bjornsson HT, Bodamer O, Chudley AE, Harris J, Kawame H, Lanpher BC, Lindsley AW, Merla G, et al. Kabuki syndrome: international consensus diagnostic criteria. J Med Genet. 2019;56(2):89–95.
  15. ESID Registry – Working Definitions for Clinical Diagnosis of PID. Available at:
  16. http://esid.org/Working­Parties/Registry/Diagnosis­criteria.
  17. Khoreva A, Pomerantseva E, Belova N, Povolotskaya I, Konovalov F, Kaimonov V, Gavrina A, Zimin S, Pershin D, Davydova N, Burlakov V, Viktorova E, Roppelt A, Kalinina E, Novichkova G, Shcherbina A. Complex Multisystem Phenotype With Immunodeficiency Associated With NBAS Mutations: Reports of Three Patients and Review of the Literature. Front Pediatr. 2020 Sep 15;8:577. doi: 10.3389/fped.2020.00577. PMID: 33042920; PMCID: PMC7522312.
  18. Tangye SG, Al-Herz W, Bousfiha A, Chatila T, Cunningham-Rundles C, Etzioni A, et al. Human Inborn Errors of Immunity: 2019 Update on the Classification from the International Union of Immunological Societies Expert Committee. J Clin Immunol. (2020) 40:24–64. doi: 10.1007/s10875-019-00737-x

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2020 .

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.